计算机科学系党总支成立于 2002年7月，现下设四个党支部，即教工党支部、学生第一党支部（04本科）、学生第二党支部（05本科，06、07本专科）、学生第三党支部（06专升本，05专），现有党员91名，其中教工党员26名，学生党员65名。

在学院党委的领导下、计算机科学系党总支认真执行“总支工作条例”，狠抓党的基层组织建设和先进性建设，在党建方面进行了积极有益的探索。在思想建设上，深化邓小平理论、 “三个代表”重要思想及科学发展观的学习，自觉锤炼党性，不断提高理论水平；在组织建设上，加强党支部自身建设，积极缎炼能力，发挥党支部的战斗堡垒作用，不断提高管理水平；在作风建设上，不断强化党员的责任意识和奉献意识，提高服务水平。计算机科学系党总支2006年度被评为院级先进党总支，学生党支部、教工党支部也曾先后被评为院级先进党支部。